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| Registros recuperados: 26 | |
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| Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Nascimento,Ana Carolina Campana; Ferreira,Reinaldo de Paula; Cruz,Cosme Damião. |
| O objetivo deste trabalho foi propor uma abordagem bayesiana do método de Eberhart & Russell para avaliar a adaptabilidade e da estabilidade fenotípica de genótipos de alfafa (Medicago sativa), bem como avaliar a eficiência da utilização de distribuições a priori informativas e pouco informativas. Foram utilizados dados de um experimento em blocos ao acaso, no qual se avaliou a produção de massa de matéria seca de 92 genótipos. A metodologia bayesiana proposta foi implementada no programa livre R por meio da função MCMCregress do pacote MCMCpack. Para representar as distribuições a priori pouco informativas, utilizaram-se distribuições de probabilidade com grande variância; e, para representar distribuições a priori informativas, adotou-se o... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Medicago sativa; Fator de Bayes; Priori informativa; Interação genótipo x ambiente; MCMC. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000100004 |
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| Nascimento,Moysés; Ferreira,Adésio; Ferrão,Romário Gava; Campana,Ana Carolina Mota; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião; Ferrão,Maria Amélia Gava; Fonseca,Aymbiré Francisco Almeida da. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar uma metodologia de análise de adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos de café baseada em regressão não paramétrica. A técnica utilizada difere das demais, pois reduz a influência na estimação do parâmetro de adaptabilidade de algum ponto extremo, ocasionado pela presença de genótipos com respostas demasiadamente diferenciadas a determinado ambiente. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produtividade média de grãos de 40 genótipos de café (Coffea canephora), com delineamento em blocos ao acaso, com seis repetições. Os genótipos foram avaliados em cinco anos (1996, 1998, 1999, 2000 e 2001), em dois locais (Sooretama e Marilândia, ES) no total de dez ambientes. A metodologia proposta... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Coffea canephora; Análise estatística; Interação genótipo x ambiente; Melhoramento genético; Pontos extremos. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2010000100006 |
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| Nascimento,Moysés; Cruz,Cosme Damião; Campana,Ana Carolina Mota; Tomaz,Rafael Simões; Salgado,Caio Césio; Ferreira,Reinaldo de Paula. |
| O objetivo deste trabalho foi alterar o método centroide de avaliação da adaptabilidade e estabilidade fenotípica de genótipos, para deixá-lo com maior sentido biológico e melhorar aspectos quantitativos e qualitativos de sua análise. A alteração se deu pela adição de mais três ideótipos, definidos de acordo com valores médios dos genótipos nos ambientes. Foram utilizados dados provenientes de um experimento sobre produção de matéria seca de 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa) realizado em blocos ao acaso, com duas repetições. Os genótipos foram submetidos a 20 cortes, no período de novembro de 2004 a junho de 2006. Cada corte foi considerado um ambiente. A inclusão dos ideótipos de maior sentido biológico (valores médios nos ambientes) resultou em... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Medicago sativa; Análise gráfica; Componentes principais; Interação genótipos x ambientes. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000300007 |
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| Barroso,Laís Mayara Azevedo; Nascimento,Moysés; Barili,Leiri Daiane; Nascimento,Ana Carolina Campana; Vale,Naine Martins do; Silva,Fabyano Fonseca e; Carneiro,José Eustáquio de Souza. |
| ABSTRACT: The aim of this study was to use quantile regression (QR) to characterize the effect of the adaptability parameter throughout the distribution of the productivity variable on black bean cultivars launched by different national research institutes (research centers) over the last 50 years. For this purpose, 40 cultivars developed by Brazilian genetic improvement programs between 1959 and 2013 were used. Initially, QR models were adjusted considering three quantiles (τ = 0.2, 0.5 and 0.8). Subsequently, with the confidence intervals, quantile models τ = 0.2 and 0.8 (QR0.2 and QR0.8) showed differences regarding the parameter of adaptability and average productivity. Finally, by grouping the cultivars into one of the two groups defined from QR0.2... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Gene-environment (GxE) interaction; Phaseolus vulgaris L; Genetic improvement; Quantiles; Regression models. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000300200 |
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| Nascimento,Moysés; Sáfadi,Thelma; Silva,Fabyano Fonseca e. |
| O objetivo deste trabalho foi determinar a melhor alternativa, entre os métodos de agrupamento hierárquico (Ward) e de otimização (Tocher), para a formação de grupos homogêneos de séries de expressão gênica, e realizar previsões quanto à expressão gênica dessas séries, a partir de pequeno número de observações temporais. Os dados utilizados referem-se à expressão de genes que atuam sobre o ciclo celular de Saccharomyces cerevisiae e corresponderam a 114 séries de expressão gênica, cada uma com dez valores de "fold-change" (medida da expressão gênica) ao longo do tempo (0, 15, 30, 45, 60, 75, 90, 105, 120 e 135 min). As estimativas dos parâmetros dos modelos autorregressivos AR(p) foram previamente ajustadas a séries individuais (de cada gene) de dados... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Bioinformática; Método de Tocher; Método de Ward; Microarranjo; Modelo autorregressivo; Série temporal. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011001100010 |
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| Silva,Gabi Nunes; Nascimento,Moysés; Sant’Anna,Isabela de Castro; Cruz,Cosme Damião; Caixeta,Eveline Teixeira; Carneiro,Pedro Crescêncio Souza; Rosado,Renato Domiciano Silva; Pestana,Kátia Nogueira; Almeida,Dênia Pires de; Oliveira,Marciane da Silva. |
| Abstract: The objective of this work was to evaluate the use of artificial neural networks in comparison with Bayesian generalized linear regression to predict leaf rust resistance in Arabica coffee (Coffea arabica). This study used 245 individuals of a F2 population derived from the self-fertilization of the F1 H511-1 hybrid, resulting from a crossing between the susceptible cultivar Catuaí Amarelo IAC 64 (UFV 2148-57) and the resistant parent Híbrido de Timor (UFV 443-03). The 245 individuals were genotyped with 137 markers. Artificial neural networks and Bayesian generalized linear regression analyses were performed. The artificial neural networks were able to identify four important markers belonging to linkage groups that have been recently mapped,... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Coffea arabica; Hemileia vastatrix; Artificial intelligence; Molecular markers; Prediction. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017000300186 |
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| Macedo,Leandro Roberto de; Cecon,Paulo Roberto; Silva,Fabyano Fonseca e; Nascimento,Moysés; Puiatti,Guilherme Alves; Oliveira,Ana Carolina Ribeiro de; Puiatti,Mario. |
| Abstract: The objective of this work was to identify nonlinear regression models that best describe dry matter accumulation curves over time, in garlic (Allium sativum) accessions, using Bayesian and frequentist approaches. Multivariate cluster analyses were made to group similar accessions according to the estimates of the parameters with biological interpretation (β1 and β3). In order to verify if the obtained groups were equal, statistical tests were applied to assess the parameter equality of the representative curves of each group. Thirty garlic accessions were used, which are kept by the vegetable germplasm bank of Universidade Federal de Viçosa, Brazil. The logistic model was the one that fit best to data in both approaches. Parameter estimates of... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Allium sativum; Cluster analysis; Multivariate clustering curves; Nonlinear models. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2017000800572 |
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| Suela,Matheus Massariol; Lima,Leísa Pires; Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e. |
| ABSTRACT: Rice cultivation has great national and global importance, being one of the most produced and consumed cereals in the world and the primary food for more than half of the world’s population. Because of its importance as food, developing efficient methods to select and predict genetically superior individuals in reference to plant traits is of extreme importance for breeding programs. The objective of this research was to evaluate and compare the efficiency of the Delta-p, G-BLUP (Genomic Best Linear Unbiased Predictor), BayesCpi, BLASSO (Bayesian Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), Delta-p/G-BLUP index, Delta-p/BayesCpi index, and Delta-p/BLASSO index in the estimation of genomic values and the effects of single nucleotide... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genomic prediction; Selection index; Genetic gain. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000600404 |
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| Nascimento,Moysés; Cruz,Cosme Damião; Peternelli,Luiz Alexandre; Campana,Ana Carolina Mota. |
| The efficiency of simulated annealing algorithms and rapid chain delineation in establishing the best linkage order, when constructing genetic maps, was evaluated. Linkage refers to the phenomenon by which two or more genes, or even more molecular markers, can be present in the same chromosome or linkage group. In order to evaluate the capacity of algorithms, four F2 co-dominant populations, 50, 100, 200 and 1000 in size, were simulated. For each population, a genome with four linkage groups (100 cM) was generated. The linkage groups possessed 51, 21, 11 and 6 marks, respectively, and a corresponding distance of 2, 5, 10 and 20 cM between adjacent marks, thereby causing various degrees of saturation. For very saturated groups, with an adjacent distance... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Better order; Genetic mapping; Genomic analyses; Stochastic optimization. |
| Ano: 2010 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572010000200032 |
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| Sousa,Ithalo Coelho de; Nascimento,Moysés; Silva,Gabi Nunes; Nascimento,Ana Carolina Campana; Cruz,Cosme Damião; Silva,Fabyano Fonseca e; Almeida,Dênia Pires de; Pestana,Kátia Nogueira; Azevedo,Camila Ferreira; Zambolim,Laércio; Caixeta,Eveline Teixeira. |
| ABSTRACT Genomic selection (GS) emphasizes the simultaneous prediction of the genetic effects of thousands of scattered markers over the genome. Several statistical methodologies have been used in GS for the prediction of genetic merit. In general, such methodologies require certain assumptions about the data, such as the normality of the distribution of phenotypic values. To circumvent the non-normality of phenotypic values, the literature suggests the use of Bayesian Generalized Linear Regression (GBLASSO). Another alternative is the models based on machine learning, represented by methodologies such as Artificial Neural Networks (ANN), Decision Trees (DT) and related possible refinements such as Bagging, Random Forest and Boosting. This study aimed to... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Hemileia vastatrix; Statistical learning; Plant breeding; Artificial intelligence. |
| Ano: 2021 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162021000401102 |
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| Barroso,Laís Mayara Azevedo; Nascimento,Moysés; Nascimento,Ana Carolina Campana; Silva,Fabyano Fonseca e; Cruz,Cosme Damião; Bhering,Leonardo Lopes; Ferreira,Reinaldo de Paula. |
| O objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar uma metodologia de análise da adaptabilidade e da estabilidade fenotípica baseada em regressão quantílica (RQ). Para tanto, foram simulados valores fenotípicos com distribuição simétrica e com distribuição assimétrica à direita e à esquerda, com ou sem a presença de "outliers". A metodologia proposta foi aplicada a um conjunto de dados provenientes de um experimento com 92 genótipos de alfafa (Medicago sativa), avaliados em 20 ambientes, e comparada às metodologias de Eberhart & Russell e de regressão não paramétrica. A metodologia da RQ proporcionou resultados iguais ou superiores aos obtidos com as metodologias alternativas avaliadas. No entanto, a ocorrência de resultados discordantes entre as... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Medicago sativa; Distribuição assimétrica; Interação genótipo x ambiente; Melhoramento vegetal; Outliers; Regressão não paramétrica.. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015000400290 |
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| Macedo,Leandro Roberto de; Silva,Fabyano Fonseca e; Cirillo,Marcelo Ângelo; Nascimento,Moysés; Paixão,Débora Martins; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Lopes,Paulo Sávio; Santos,Jussara Aparecida dos; Azevedo,Camila Ferreira. |
| Para avaliar a influência do gene halotano sobre a curva de crescimento de suínos, bem como sua interação com o sexo do animal, foi proposta uma modelagem hierárquica Bayesiana. Nesta abordagem, os parâmetros dos modelos não-lineares de crescimento (Logístico, Gompertz e von Bertalanffy) foram estimados conjuntamente com os efeitos de sexo e genótipos do gene halotano. Foram utilizados 344 animais F2(Comercial x Piau) pesados ao nascer, aos 21, 42, 63, 77, 105 e 150 dias. O modelo Logístico foi aquele que apresentou melhor qualidade de ajuste por apresentar menor DIC (Deviance Information Criterion) que os demais. As amostras das distribuições marginais a posteriori para as diferenças entre as estimativas dos parâmetros do modelo Logístico indicaram que o... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Melhoramento; Modelos não-lineares; Síndrome do estresse suíno. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001001853 |
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| Reis,Renata M; Cecon,Paulo R; Puiatti,Mário; Finger,Fernando L; Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano F; Carneiro,Antônio PS; Silva,Anderson R. |
| O principal objetivo deste estudo foi comparar modelos de regressão não linear aptos a descreverem o acúmulo de massa seca de diferentes partes da planta do alho ao longo do tempo (60, 90, 120 e 150 dias após plantio). Objetivou-se também identificar acessos semelhantes em relação às características avaliadas por meio de análises de agrupamento. Foram utilizados 20 acessos de alho pertencentes ao Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH/UFV). O teor de massa seca da folha, do pseudocaule, do bulbo e da raiz foram definidos como variáveis na análise de agrupamento (algoritmo de Ward utilizando como medida de dissimilaridade a distância quadrada generalizada de Mahalanobis), que resultou na indicação de um número ótimo... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Allium sativum; Análise de agrupamento; Comparação de modelos. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362014000200178 |
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| Silva,Gabi Nunes; Tomaz,Rafael Simões; Sant'Anna,Isabela de Castro; Nascimento,Moysés; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião. |
| Analysis using Artificial Neural Networks has been described as an approach in the decision-making process that, although incipient, has been reported as presenting high potential for use in animal and plant breeding. In this study, we introduce the procedure of using the expanded data set for training the network. Wealso proposed using statistical parameters to estimate the breeding value of genotypes in simulated scenarios, in addition to the mean phenotypic value in a feed-forward back propagation multilayer perceptron network. After evaluating artificial neural network configurations, our results showed its superiority to estimates based on linear models, as well as its applicability in the genetic value prediction process. The results further... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genetic value; Statistics; Simulation; Artificial intelligence; Training strategy. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162014000600008 |
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| Lima,Leísa Pires; Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Silva,Fabyano Fonseca e; Suela,Matheus Massariol; Nascimento,Moysés; Viana,José Marcelo Soriano. |
| ABSTRACT: Genome-wide selection (GWS) is based on a large number of markers widely distributed throughout the genome. Genome-wide selection provides for the estimation of the effect of each molecular marker on the phenotype, thereby allowing for the capture of all genes affecting the quantitative traits of interest. The main statistical tools applied to GWS are based on random regression or dimensionality reduction methods. In this study a new non-parametric method, called Delta-p was proposed, which was then compared to the Genomic Best Linear Unbiased Predictor (G-BLUP) method. Furthermore, a new selection index combining the genetic values obtained by the G-BLUP and Delta-p, named Delta-p/G-BLUP methods, was proposed. The efficiency of the proposed... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genomic prediction; Selection index; Genetic gain; Asian rice. |
| Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162019001400290 |
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| Puiatti,Guilherme Alves; Cecon,Paulo Roberto; Nascimento,Moysés; Nascimento,Ana Carolina Campana; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Silva,Fabyano Fonseca e; Puiatti,Mário; Cruz,Cosme Damião. |
| ABSTRACT: The objective of this study was to adjust nonlinear quantile regression models for the study of dry matter accumulation in garlic plants over time, and to compare them to models fitted by the ordinary least squares method. The total dry matter of nine garlic accessions belonging to the Vegetable Germplasm Bank of Universidade Federal de Viçosa (BGH/UFV) was measured in four stages (60, 90, 120 and 150 days after planting), and those values were used for the nonlinear regression models fitting. For each accession, there was an adjustment of one model of quantile regression (τ=0.5) and one based on the least squares method. The nonlinear regression model fitted was the Logistic. The Akaike Information Criterion was used to evaluate the goodness of... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Quantile regression; Nonlinear regression; Allium sativum L.; Growth rate; Cluster analysis.. |
| Ano: 2020 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782020000100203 |
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| Salgado,Caio Césio; Cruz,Cosme Damião; Nascimento,Moysés; Barrera,Carlos Felipe Sanches. |
| O objetivo deste trabalho foi desenvolver um processo de integração de mapas genéticos, com o uso do inverso da variância, e testar sua eficiência. Foram utilizadas populações simuladas F2 codominante e de retrocruzamento, com tamanhos populacionais de 100, 150, 200 e 400 indivíduos, tendo-se considerado uma espécie diploide fictícia com 2n = 2x = 2 cromossomos, com o comprimento total do genoma por grupo de ligação estipulado em 100 cM, 21 marcas por grupo de ligação e marcadores equidistantes em 5 cM. Os genomas foram comparados quanto ao tamanho do grupo de ligação, variância das distâncias entre marcas adjacentes, correlação de Spearman e quanto ao estresse relativo à adequação das distâncias estimadas. Cada genoma simulado foi fragmentado em quatro... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Frequência de recombinação; Grupos de ligação; Marcador molecular; Tensão interna. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000100009 |
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| Teodoro,Paulo Eduardo; Nascimento,Moysés; Torres,Francisco Eduardo; Barroso,Laís Mayara Azevedo; Sagrilo,Edvaldo. |
| Resumo:O objetivo deste trabalho foi selecionar, sob a perspectiva bayesiana, genótipos de feijão-caupi (Vigna unguiculata) que reúnam alta adaptabilidade e estabilidade fenotípicas, no Estado do Mato Grosso do Sul. Foram utilizados dados de quatro experimentos, conduzidos em delineamento de blocos ao acaso, em que a produtividade de grãos de 20 genótipos de feijão-caupi semiprostrado foi avaliada. Para representar as distribuições a priori pouco informativas, utilizaram-se distribuições de probabilidade com grande variância; e, para representar distribuições a priori informativas, adotou-se o conceito de metanálise, com uso de informações de trabalhos anteriores. A comparação entre as distribuições a priori foi realizada por meio do fator de Bayes. A... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Vigna unguiculata; Fator de Bayes; Interação genótipo x ambiente; Metanálise; Priori informativa.. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015001000878 |
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